Az intelligens szakosodási koncepció lényege, hogy az innovációs és gazdaságfejlesztési szakpolitikai beavatkozásokat nagy innovációs potenciállal és versenyelőnnyel kecsegtető prioritási területekre fókuszálja, amelyek kapcsolódnak egy nemzetgazdaság vagy egy régió adottságaihoz, valamint egy alulról szerveződő, az érintettek bevonásával zajló ún. vállalkozói felfedező folyamat (Entrepreneurial Discovery Process, EDP) mentén kerülnek meghatározásra.

A 2021 és 2027 között érvényes magyarországi S3 dokumentumban az ún. nemzetgazdasági prioritások jelölik ki azokat az irányokat a nemzetgazdaság számára, amelyre Magyarország az intelligens szakosodás megvalósítása során fókuszál.

A nemzetgazdasági prioritások mellett két horizontális prioritás is meghatározásra került. A horizontális prioritások feladata, hogy a nemzetgazdasági prioritásokban érdekelt ágazatok számára az intelligens szakosodáshoz szükséges készségfejlesztést és üzleti környezetet biztosítsák.